新疆铁道勘察设计院有限公司由原铁一院新疆分院、乌鲁木齐铁路局勘测设计院整体合并重组改制而成。原铁一院新疆分院是新中国成立的批铁路勘测设计单位，始建于1953年，1955年进疆，是铁道勘察设计院设在新疆的分支机构，主要承担疆内疆外国家长大铁路干线的勘察设计任务。几十年来承担了兰新铁路、南疆铁路、北疆铁路、青新铁路、兰新铁路复线、南疆铁路西延工程、精伊霍铁路、中吉乌国际铁路等国家长大铁路干线的勘察设计任务。还承担了区外山西阳涉、侯月、宁静铁路，江苏新长铁路、青藏铁路安多至桑利段铁路、襄渝铁路、内蒙临策铁路、包西铁路等国家长大铁路干线勘察设计任务。以“信守合同、质量、客户至上、全程服务”的企业宗旨创造出7项省部级优秀勘察、设计成果；获省部级6个优秀质量管理小组成果奖。国家和省部级重点建设项目遍及新疆和其他省、市、自治区，建成投入运营里程达10000余公里，为新疆和的铁路建设事业做出了贡献。

新疆铁道勘察设计院有限公司，是集工程勘察、工程设计、工程咨询、工程总承包、工程测绘、工程实验为一体的以铁路勘察设计为核心竞争力的综合性勘察设计企业。1995年在全行业率先通过中国船级社ISO9001质量体系认证，2009年取得“质量、环境、职业健康安全”三体系认证。持有工程设计铁道行业甲级、建筑行业建筑工程甲级、市政公用行业轨道交通工程甲级，工程勘察甲级，工程咨询铁路、建筑、水文地质、工程测量、岩土工程、市政公用工程、公路专业甲级，工程设计市政公用行业、公路工程乙级，国家乙级测绘资格，国家计量（实验室）资质，国家特种设备（压力管道）设计资质。新疆铁道院是中国勘察设计协会、中国工程咨询协会、中国铁道勘察设计协会等知名组织的会员单位。