洱源县水务局是县人民政府的职能部门，对县人民政府负责；内设8个股室：办公室、财务室、农村水利股、水政水资源股（加挂洱源县水行政综合执法大队牌子）、水土保持股（洱源县水土保持委员会办公室）、防汛抗旱股（洱源县防汛抗旱指挥部办公室、副科级）、供排水股、农村水电股（水电农村电气化建设办公室）。