西安航天神舟建筑设计院隶属于中国航天科技集团公司第四研究院，成立于1984年10月，当时单位名称为航天工业部第四研究院建筑设计室，1997年7月更名为中国航天工业总公司第四研究院建筑设计所，2001年12月更名为西安航天神舟建筑设计院。
    1992年我院取得中国航天工业总公司颁发的航天工程、建筑工程、市政工程丙级设计资质；1997年取得建设部颁发的军工工程、建筑工程乙级设计资质；2000年取得国家发改委颁发的工程咨询甲级资质；2002年取得陕西省建设厅颁发的城市规划丙级设计资质；2003年质量体系通过陕西方圆认证中心ISO9001-2002认证审核；2005年通过军工保密资格二级认证审核。2008年取得中华人民共和国建设部颁发的建筑行业建筑工程甲级和军工行业（航天空间飞行器、导弹及火箭弹）甲级设计资质；2008年取得工程建设招标代理资质。2011年取得防雷工程乙级设计资质。
    2001年成立北京分院，到目前为止北京分院已相对独立的开展设计、咨询工作。